Titre original : Meta-analysis and multidisciplinary consensus statement: exome sequencing is a first-tier clinical diagnostic test for individuals with neurodevelopmental disorders.
Auteurs (ordre de publication) : Siddharth Srivastava ; Jamie A. Love-Nichols ; Kira A. Dies ; David H. Ledbetter ; Christa L. Martin ; Wendy K. Chung ; Helen V. Firth ; Thomas Frazier ; Robin L. Hansen ; Lisa Prock ; Han Brunner ; Ny Hoang ; Stephen W. Scherer ; Mustafa Sahin (auteur correspondant) ; David T. Miller ; NDD Exome Scoping Review Work Group. ORCID : Non disponible. Affiliations : Translational Neuroscience Center, Department of Neurology, Boston Children's Hospital, Harvard Medical School, Boston, États-Unis (Srivastava, Love-Nichols, Dies, Sahin ; Prock, également Developmental Medicine Center) ; Autism & Developmental Medicine Institute, Geisinger, Danville, États-Unis (Ledbetter, Martin) ; Columbia University et SFARI, Simons Foundation, New York (Chung) ; Wellcome Sanger Institute et East Anglian Medical Genetics Service, Cambridge, Royaume-Uni (Firth) ; Autism Speaks, Cleveland (Frazier) ; MIND Institute, UC Davis, Sacramento (Hansen) ; Radboud University Medical Center, Donders Institute, Nijmegen, et Maastricht UMC, Pays-Bas (Brunner) ; The Hospital for Sick Children et University of Toronto, Canada (Hoang, Scherer) ; Division of Genetics and Genomics, Boston Children's Hospital (Miller).
Revue : Genetics in Medicine. Éditeur : Nature Publishing Group (Springer Nature, pour l'American College of Medical Genetics and Genomics). Date : mise en ligne le 11 juin 2019 (reçu le 20 février 2019, accepté le 15 mai 2019) ; numéro de novembre 2019. Volume 21, numéro 11, pages 2413-2421. Correction : Genetics in Medicine, 2020;22(10):1731. DOI : 10.1038/s41436-019-0554-6. PMID : 31182824. PMCID : PMC6831729. URL : https://doi.org/10.1038/s41436-019-0554-6. Texte intégral : https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6831729. Licence : CC BY-NC-ND 4.0.
Type d'étude et méthodologie : revue de la littérature PubMed (2014 à juin 2018) avec méta-analyse du rendement diagnostique, servant de base à une conférence de consensus réunissant généticiens, neuropédiatres et pédiatres du développement. Population : personnes avec retard global de développement, handicap intellectuel et/ou TSA. Échantillon : 30 articles (21 sur des TND isolés, 9 sur des TND avec signes associés) ; nombre total de participants non indiqué.
Résumé original : disponible à l'URL de la publication (non reproduit ici).
Synthèse en français : le rendement diagnostique de l'exome est de 36 % (IC 95 % : 30-43) au total, 31 % pour les TND isolés et 53 % pour les TND avec signes associés, nettement supérieur à celui de l'analyse chromosomique sur puce à ADN (ACPA), estimé à 15 à 20 %. Dans les sous-groupes isolés, il est de 16 % pour les TSA prédominants et de 39 % pour le handicap intellectuel prédominant. Le diagnostic a modifié la prise en charge chez environ 30 % des patients diagnostiqués.
Conclusions cliniques : les auteurs proposent un algorithme plaçant l'exome au début de l'évaluation étiologique des TND inexpliqués.
Limites : protocole non enregistré (revue de cadrage) ; critères phénotypiques stricts ; caractéristiques de population déduites dans 9 études ; méthodes de classification des variants hétérogènes ; ADN mitochondrial non analysé ; coût-efficacité non évalué ; biais de publication possible.
Mots-clés : autisme ; conférence de consensus ; rendement diagnostique ; tests génétiques ; handicap intellectuel ; séquençage de l'exome.
Références : Srivastava S, Love-Nichols JA, Dies KA, et al. Meta-analysis and multidisciplinary consensus statement: exome sequencing is a first-tier clinical diagnostic test for individuals with neurodevelopmental disorders. Genetics in Medicine. 2019;21(11):2413-2421. DOI : 10.1038/s41436-019-0554-6.
